Точная дата основания Ищёрской неизвестна. Первое упоминание относится к 1771 году, когда была организована Моздокская казачья линия, в состав которой и вошла станица. В 1772 году в Ищёрской побывал Емельян Пугачёв, которого станичные казаки отправили в Москву с ходатайством о выделении денежного жалования и провианта, однако уже на посту в Моздоке Пугачёв был задержан (впоследствии ему удалось сбежать из-под стражи).

В 1832 г. количество домов – 290, в которых проживало 1077 мужчин и 1156 женщин.

На 1 июля 1843 года в станице проживало 1668 мужчин и 1736 женщин.

Станичные строения в 1844 году:

Приходских церквей – 1, приходских училищ – 0, полковых обществен-ных строений – 0, станичных общественных строений – 3. Домов: гос-подских – 13, казачьих – 442, крестьянских – 0. Лавок – 4, питейных до-мов – 1, кузниц – 1, мельниц – 9.

Еще в канцелярии наказного атамана интересовались наличием мужских и женских монастырей, каменных соборов, уездных гимназий, казённых строений, трактиров, харчевен. А также заводами: водочными, виноку-ренными, салотопными, кирпичными и рыбоспечными.

В 1891 году войсковой старшина Т. А. Сафонов (около 80 лет), по поводу переселения казаков с Волги рассказывал, что казаки, под командою Савельева Ивана Дмитриевича, пришли 4-мя сотнями. Первую сотню привел в Ищеры прадед его есаул Александр Иванович Сафонов; вторую, в Наур,— есаул Агафонов; третью в ст. Галюгаевскую,—есаул Венеровский и четвертую, в ст. Мекенскую,—есаул Старицкий. Сафонов пришел в Ищеры с 4-мя сыновьями— Прокофием, Данилой (Т. А. Сафонов его внук; был женат на Пелагее Головановой), Антоном и Харитоном и, как сотенный, захватил для себя и сыновей лучшие места, на площади; тоже сделал он и по отношению к Головановым.

По состоянию на 1926 год станица Ищёрская относилась к Ищёрскому сельсовету Наурского района Терского округа Северо-Кавказского края. Согласно переписи населения 1926 года в станице проживало 4312 человек, из них великороссов — 3255.